En efecto. En la programación debes especificar que criterios vas a usar para la calificación. Que porcentaje para los trabajos, exámenes, actitud, etc, es decir los criterios que usaras para el
curso entero.
Mientras que en la unidad didáctica al exponerla debes de indicar como calificaras esa unidad en concreto, si vas a hacer examen, o un trabajo, o si lo meterás con otras unidades para hacer examen global, etc. Y ten cuidado con esto porque debe ir paralelo a lo que digas en la programación.